中國科學院上海有機化學研究所是集基礎研究、應用研究和高技術創新研究為一體的綜合性化學研究機構，從開展***和高分子化學的研究起步，經過70多年幾代人艱苦創業、奮力拼搏，在以有機化學研究為中心的基礎研究、應用研究與高新技術開發、人才培養等方面均取得令人矚目的成就。在我國“兩彈一星”研制、“人工合成牛胰島素、人工合成酵母丙氨酸轉移核糖核酸”和“物理有機化學中的兩個基本問題自由基化學中取代基離域參數和有機分子簇集概念”等一批攀登科技高峰的重要成果中，我所科研人員作出了重要貢獻。下設科研部門生命有機實驗室、金屬有機實驗室、有機氟化學實驗室、天然產物合成實驗室、合成與組裝實驗室、能量調控實驗室、生物與化學交叉中心、滬港化學合成聯合實驗室。